如果樣品裡面有水大於100mg該加多少

時間 2021-08-30 09:29:34

1樓:濤濤濤

使用說明書,看了嗎?trizol,我用的少,我用的比較多的是typhon(往聖的)。給你發個typhon的說明書吧。

oneshine typhon total rna extraction reagent 總rna提取試劑是一種可以用於動物、植物、微生物、病毒總rna抽提的試劑,具有極強的細胞或病毒顆粒裂解能力,可在短時間內裂解各種生命形式的基本單位。本品含有能夠有效抑制rnase的有機試劑,最大限度地減少總rna的降解。用本產品提取的總rna純度高,不含基因組dna,可以直接用於northern blotting、斑點雜交、mrna純化、體外翻譯、rt-pcr、poly(a)+選擇、rna酶保護分析以及構建cdna文庫等多種分子生物學實驗。

經過本產品處理後,離心管中的液體分為三層,rna在上層水相中,而中間層固體相和下層有機相中則分別包含dna和蛋白質。因此可以對中間層和下層進行深度處理,以求獲得總dna和總蛋白;dna的獲取用乙醇沉澱即可,而蛋白質的獲取則採用異丙醇沉澱法。

本產品操作簡便快捷,可以在一小時內完成所有實驗。

ii運輸與儲存方法

採用冰袋運輸4℃避光儲存,有效期一年。儲存時應封口密閉,不宜長時間暴露於空氣中,以免產品遭到氧化而失效。

iii注意事項

1.本產品中含有苯酚、β-巰基乙醇等有毒試劑,具有毒性和腐蝕性,操作時要做好保護措施並在通風櫥內進行取用,不可掉以輕心。如果不慎接觸**或粘膜,應立即轉移至通風場地並用大量的自來水沖洗或漱洗,必要時及時就醫。

2.需自備氯仿、異丙醇、75%乙醇、depc處理水等(本公司均有售),所有吸頭、離心管、pcr管、玻璃容器等要用depc水處理或高溫烘烤後才能使用,防止rnase對總rna的降解(本公司均有售)。

3.樣品用total rna extraction reagent勻漿後,如果不加入氯仿進行下游實驗,先-70℃凍存,可儲存一個月以上。建議抽提總rna後儘快進行後續實驗,短暫儲存應放置在-70℃中,只能凍融一次。

4.過多的樣本量可能會導致裂解不充分,使產物純度降低和汙染。在吸取上清液時,不可貪多和焦急,吸取後所剩上清液的液麵距中間層至少有2mm以上,以免吸取到中間層導致dna的汙染,使後續實驗出現假陽性。

v操作流程

rna的提取

準備試劑

氯仿,異丙醇,75%乙醇,無rnase的水或0.5%sds(溶液均需用depc處理過的水配製)。

操作步驟

1.勻漿處理

a、組織:將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml typhon;肝臟、腦等柔軟組織用勻漿儀進行勻漿處理。然後加入1mltyphon,反覆輕柔吹打,直至溶液不抽絲,樣品體積不應超過typhon體積10%。

b、單層培養細胞:去除細胞培養基,pbs沖洗一次,直接在培養板中加入typhon裂解細胞,每250px2面積加1ml,用移液器吸打幾次,轉移至1.5ml離心管,反覆吹打,直至溶液不抽絲。

typhon的用量應根據培養板面積而定。typhon加量不足可能導致提取的rna有dna汙染。

c、細胞懸液:離心收集細胞,每5-10×106動物、植物、酵母細胞或1×107細菌細胞加入1ml typhon,反覆吸打直至溶液不抽絲。加typhon之前不要洗滌細胞以免mrna降解。

一些酵母和細菌細胞需用勻漿儀處理。

2.將勻漿樣品在室溫(15-30℃)放置5分鐘,使核酸蛋白複合物完全分離。

3.可選步驟:如樣品中含有較多蛋白質,脂肪,多糖或胞外物質(肌肉,植物結節部分等)可於2-8℃ 12000×g離心10分鐘,取上清。離心得到的沉澱中包括細胞外膜,多糖,高分子量dna,上清中含有rna。

處理脂肪組織時,上層有大量油脂應去除,取澄清的勻漿液進行下一步操作。

4.第一步每使用1ml typhon加入0.2ml氯仿,輕柔振盪或吹吸15秒,室溫放置3分鐘。

5.2-8℃ 12000×g離心15分鐘。樣品分為三層:底層為黃色有機相,上層為無色或淡黃色水相,中間為固相。rna主要在水相中,水相體積約為所用typhon試劑的60%。

6.把水相轉移到新管中(如要分離dna和蛋白質可保留有機相),用異丙醇沉澱水相中的rna。每使用1ml typhon加入0.5ml異丙醇,室溫放置10分鐘。

7.2-8℃ 10000×g離心10分鐘,離心前看不出rna沉澱,離心後在管側和管底出現膠狀沉澱。移去上清。

8.用75%乙醇洗滌rna沉澱。每使用1ml typhon至少加1ml 75%乙醇。2-8℃不超過7500×g離心5分鐘,棄上清。

9.室溫放置乾燥或真空抽乾rna沉澱,不要晾得過幹,否則不易溶解,大約晾5-10分鐘。加入25-200μl無rnase的水或0.5%sds(本公司均有售),用槍頭吸打幾次,55-60℃放置10分鐘使rna溶解。

如rna用於酶切反應,勿使用sds溶液。rna也可用100%的去離子甲醯胺溶解。-70℃儲存。

rna的提取注意事項

1.從少量樣品(1-10mg組織或102-104細胞)中提取rna是可加入少許糖原以促進rna沉澱。例如加800μl typhon勻漿樣品,離心取上清液後,異丙醇沉澱rna前加5-10ug rnase-free糖原。糖原會與rna一同沉澱出來,糖原濃度不高於4mg/ml不影響第一鏈的合成,也不影響pcr反應。

2.勻漿後加入typhon,加氯仿之前樣品可在-60—-70℃儲存至少一個月。rna沉澱可儲存在75%酒精中2-8℃一個星期以上或-5—-20℃一年以上。

3.分層和rna沉澱時也可使用低速臺式離心機,2600×g離心30-60分鐘。

rna的提取常見問題分析

得率低:

a.樣品裂解或勻漿處理不徹底

b.rna沉澱未完全溶解

a260/a280<1.65:

a.檢測吸光度時,rna樣品沒有溶於水,而溶於了te中。低離子濃度和低ph值條件下a280值偏高。

b.樣品勻漿時加的試劑量太少。

c.勻漿樣品時未在室溫放置5分鐘。

d.吸取水相時混了有機相。

e.rna沉澱未完全溶解。

rna降解:

a.組織取出後沒有馬上處理或冷凍

b.待提取rna的樣品沒有儲存於-60至-70℃,而儲存在了-5至-20℃

c.細胞在胰酶處理時過度

d.溶液或離心管未經rnase去除處理

e.電泳時使用的甲醛ph值低於了3.5

dna汙染:

a.樣品勻漿時加的試劑量太少

b.樣品中含有有機溶劑(如乙醇,dmso等),強緩衝液或鹼性溶液

蛋白聚糖和多糖汙染:

沉澱rna的過程中作以下改進可去除這些汙染,步驟7中,每使用1mltyphon在水相中加0.25ml異丙醇和0.25ml高鹽溶液(0.

8m檸檬酸鈉和1.2mnacl)混合離心,按之前操作進行。這種方法可使蛋白聚糖和多糖留在溶液中,高效沉澱出純rna。

從含有大量多糖的植物中提取rna時應在勻漿後離心,加入以上操作步驟。

dna的分離

準備試劑

乙醇、0.1m檸檬酸鈉(含10%乙醇)、75%乙醇、8mm naoh

操作步驟

1.樣品加氯仿分層後,移去上層水相,用乙醇沉澱中間層和有機相中的dna。每使用1mltyphon加0.3ml無水乙醇混勻,室溫放置3分鐘,2-8℃不超過2000×g離心5分鐘。

2.移去上清,(如需要分離蛋白質,可保留,進一步操作見後)用含10%乙醇的0.1m檸檬酸鈉洗滌dna沉澱。每用1mltyphon加入1ml檸檬酸鈉,室溫放置30分鐘,2-8℃2000×g離心5分鐘,棄上清,重複一次。

3.用75%乙醇再洗一遍dna沉澱,每使用1mltyphon加入1.5-2ml75%乙醇,室溫放置10-20分鐘(不時顛倒混合)2-8℃2000×g離心5分鐘,棄上清。

4.室溫放置晾乾dna5-15分鐘,用8mmnaoh溶解dna。從50-70mg組織或10細胞中分離的dna溶於300-600μl8mmnaoh,dna的濃度通常為0.2-0.

3μg/μl。提取的dna沉澱不易溶於水和tris緩衝液中,建議用弱鹼溶解,8mmnaoh的ph值為9,溶解dna後可用te、hepes調節ph。從某些樣品(尤其是組織)中提取的dna中可能包含一些膠狀不溶物,可》12000×g離心10分鐘除去。

dna的定量

取一份溶於8mmnaoh的dna加水測a260值。一單位a260值相當於50μg/ml雙鏈dna。理論上,人、大鼠、小鼠1×106二倍體細胞含dna的量約分別為7.

1μg,6.5μg,5.8μg。

分離dna的應用

1.用於pcr 溶於8mmnaoh的dna用0.1mhepes調ph至8.4,取0.1-1μgdna用作pcr模板。

2.酶切反應 用hepes或1mmedta調節ph至適當值。每μgdna使用3-5單位的酶,酶用量為3-5 iv/mgdna。

dna分離注意事項

1.dna在中間層和有機相中時可在2-8℃儲存過夜。

2.dna沉澱在75%乙醇中2-8℃可儲存數月。

3.dna在8mmnaoh溶液中4℃可放置過夜,如長期儲存需用hepes調節ph至7-8並且加edta至1mm可置於4℃或-20℃長期儲存。

dna的分離常見問題分析

得率低a.樣品勻漿和裂解的不徹底

b.最終得到的dna沉澱沒有完全溶解

a260/a280<1.70

a.檢測吸光度時,rna樣品沒有溶於水,而溶於了te中

b.酚除去不徹底,可用0.1m檸檬酸鈉(含10%乙醇)再洗一遍dna沉澱。

dna降解

a.組織取出後沒有馬上處理或冷凍

b.待提取rna的樣品沒有儲存於-60至-70℃,而儲存在了-5至-20℃

c.樣品勻漿時使用了高速勻漿儀

rna汙染

a.氯仿分層後水相未完全去除

b.dna沉澱用0.1m檸檬酸鈉(含10%乙醇)洗脫不徹底

蛋白質的分離

準備試劑

異丙醇、含0.3m鹽酸胍的95%乙醇、無水乙醇、1%sds

操作步驟

1.取沉澱dna後剩餘的上清,用異丙醇沉澱蛋白質。每使用1mltyphon加1.5ml異丙醇,室溫放置10分鐘,2-8℃12000×g離心10分鐘棄上清。

2.用含0.3m鹽酸胍的95%乙醇洗滌蛋白質沉澱。每使用1mltyphon加2ml洗滌液,室溫放置20分鐘,2-8℃7500×g離心5分鐘,棄上清,重複兩次。

用2ml無水乙醇同樣方法再洗一次。

3.真空抽乾蛋白質沉澱5-10分鐘,用1%sds溶解蛋白質,反覆吸打,50℃水浴使其完全溶解,不溶物2-8℃10000×g離心10分鐘除去。分離得到的蛋白質樣品可用於westernblot或-5--20℃儲存備用。

蛋白質的提取注意事項

1.蛋白質沉澱可儲存在含0.3m鹽酸胍的95%乙醇或無水乙醇中2-8℃一個月以上或-5--20℃一年以上。

2.用0.1%sds在2-8℃透析三次,10000×g離心10分鐘取上清即可用於western blot。

蛋白質的提取常見問題分析

得率低:

a.樣品裂解或勻漿處理不徹底

b.最後得到的蛋白質沉澱未完全溶解

蛋白質降解:

組織取出後沒有馬上處理或冷凍

電泳時條帶變形:

蛋白質沉澱洗滌不充分

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