如何確定某個基因是否為轉錄因子,如何證明某個基因受轉錄因子的直接調控,簡述實驗設計

時間 2021-08-15 18:04:42

1樓:翰林學庫

dof轉錄因子家族在植物生長髮育和基因表達調控過程中具有重要的作用,本文利用公佈的玉米基因組草圖資料,利用生物資訊學方法對玉米全基因組dof基因的結構、系統進化關係和保守motif進行了分析。結果表明:玉米中共有18個dof型別基因,命名為zmdof1-zmdof18,其蛋白質長度在211aa至618aa之間,通過系統進化樹分析後,18個dof基因可以明顯的分為三類,此外玉米dof基因的數目遠遠小於水稻和擬南芥,基因複製現象較少是玉米dof基因數量較少的原因之一,meme分析證實了dof基因含有三個保守的motif。

對玉米dof型別基因的系統分析,將有助於玉米dof型別基因的克隆和功能的進一步研究。

2樓:逛逛踉蹌

如果此轉錄因子能夠啟用靶啟動子,則熒光素酶基因就會表達,從而對基因的表達起抑制或增強的作用,通過檢測熒光的強度可以測定熒光素酶的活性:(1)構建一個將靶啟動子的特定片段插入到熒光素酶表達序列前方的報告基因質粒,熒光素酶與底物反應,如pgl3-basic等。(3) 加入特定的熒光素酶底物轉錄因子是一種具有特殊結構,也稱為反式作用因子。

熒光素酶報告基因實驗(luciferase assay)是檢測這類轉錄因子和其靶啟動子中的特異順序結合的重要手段,這些特異性的序列被稱為順式作用元件、行使調控基因表達功能的蛋白質分子。某些轉錄因子僅與其靶啟動子中的特異序列結合。(2) 將要檢測的轉錄因子表達質粒與報告基因質粒共轉染293細胞或其它相關的細胞系,轉錄因子的dna結合域和順式作用元件實現共價結合。

其原理簡述如下,從而判斷轉錄因子是否能與此靶啟動子片段有作用,熒光素酶的表達量與轉錄因子的作用強度成正比,產生熒光

如何證明某個基因受轉錄因子的直接調控,簡述實驗設計

3樓:匿名使用者

如果此轉錄因子能夠啟用靶啟動子,則熒光素酶基因就會表達,從而對基因的表達起內抑制或增強的作用容,通過檢測熒光的強度可以測定熒光素酶的活性:(1)構建一個將靶啟動子的特定片段插入到熒光素酶表達序列前方的報告基因質粒,熒光素酶與底物反應,如pgl3-basic等。(3) 加入特定的熒光素酶底物轉錄因子是一種具有特殊結構,也稱為反式作用因子。

熒光素酶報告基因實驗(luciferase assay)是檢測這類轉錄因子和其靶啟動子中的特異順序結合的重要手段,這些特異性的序列被稱為順式作用元件、行使調控基因表達功能的蛋白質分子。某些轉錄因子僅與其靶啟動子中的特異序列結合。(2) 將要檢測的轉錄因子表達質粒與報告基因質粒共轉染293細胞或其它相關的細胞系,轉錄因子的dna結合域和順式作用元件實現共價結合。

其原理簡述如下,從而判斷轉錄因子是否能與此靶啟動子片段有作用,熒光素酶的表達量與轉錄因子的作用強度成正比,產生熒光

如何判斷某個轉錄因子和它的靶基因啟動子序列發生了結

4樓:匿名使用者

轉錄因子一半都結合覆在被制調控基因

的promoter區域,你可以做一個chip-seq實驗,然後在基因組資料庫中定位這些與該轉錄因子結合的dna區域,那麼這些區域的下游附近的基因就很可能是受該轉錄因子調控的基因。然後在針對這些疑似基因做轉錄因子ko之後的該基因mrna水平檢測(realtimepcr)確定是否受其調控。

如何在pubmed中查與某個基因相關的轉錄因子

怎麼查一個轉錄因子調控的下游基因

5樓:苦味精味苦

轉錄因子一半都結合在被調控基因的promoter區域,可以做一個chip-seq實驗,然後在基因組專

資料庫中定位這些屬與該轉錄因子結合的dna區域.

那麼這些區域的下游附近的基因就很可能是受該轉錄因子調控的基因。

然後在針對這些疑似基因做轉錄因子ko之後的該基因mrna水平檢測(realtimepcr)確定是否受其調控。

6樓:人生如夕陽

轉錄因子一半來都結合在自被調控基因的promoter區域,你可以做一個chip-seq實驗,然後在基因組

資料庫中定位這些與該轉錄因子結合的dna區域,那麼這些區域的下游附近的基因就很可能是受該轉錄因子調控的基因。然後在針對這些疑似基因做轉錄因子ko之後的該基因mrna水平檢測(realtimepcr)確定是否受其調控。

如何**一個轉錄因子是否結合目的基因

7樓:搞定基因

佳學基因調節因子序列與功能資料庫具有這個功能。

8樓:七喜愛上可樂

佳學基因的基因解碼技術

9樓:為了她我願意愛

是**嗎?而不是判斷

如何確定某個域名伺服器是否工作正常

悉月明 最簡單的方法雙域名測試法 二個域名分別不同的域名伺服器解析到同一ip的虛擬主機二個域名也訪問不了 多是虛擬主機問題 一個域名能訪問,別一個域名不能訪問,不能訪問的域名伺服器出問題現在域名註冊商比夠好的有 萬網 國內域名註冊量第二,啊裡巴巴旗下公司 新網 國內域名註冊量第一,香港上市公司新網數...

如何確定是否為胰腺炎

診斷主要根據臨床表現,實驗室檢查和影像學發現。1 實驗室檢查 1 胰酶測定 血清澱粉酶測定是被最廣泛應用的診斷方法。血清澱粉酶增高在發病後24小時內可被測得,血清澱粉酶值明顯升高 500u dl 正常值40 180u dl,somogyi法 其後7天內逐漸降至正常。尿澱粉酶測定也為診斷本病的一項敏感...

如何確定平板上某單個菌落是否為純培養

江上過客 純培養的確定除觀察其菌落特徵外,還要結合顯微鏡檢測個體形態特徵後才能確定,有些微生物的純培養要經過一系列分離與純化過程和多種特徵鑑定才能得到。 打死青椒 菌落是由單個細菌細胞或一堆同種細胞在適宜固體培養基表面或內部生長繁殖到一定程度,形成肉眼可見的子細胞群落。通常情況下,單個菌落就是純培養...