生物化學 蛋白質二級結構形成穩定的螺旋結構至少需要多少個氨基酸殘基?答案可能是15需要詳細解釋

時間 2021-08-31 07:23:22

1樓:冬令營11維空間

王鏡巖的《生物化學》,螺旋平均每個螺旋是3.6個氨基酸殘基(《蛋白質結構物理學 》 一書也 給出的是平均3.6)。

含有n個殘基的α螺旋就含有n-4個氫鍵,因為螺旋頂頭的4個醯胺氫和 4個羰基氧不參與螺旋氫鍵形成。

王鏡巖生化 給出的一個典型α螺旋 是12個殘基。

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那麼要完成一次α螺旋需要3.6個殘基四捨五入為4個。  那麼這4個殘基都是 參與螺旋氫鍵氫鍵形成的。

那麼第一的羰基氧是和第5個殘基的氨基氫,第2個羰基氧是和第6個殘基的氨基氫以此類推。第4個羰基氧是和第8個殘基的氨基氫。

那麼完成一個α螺旋就需要最少8氨基酸。  (這是我個人看法,也僅僅是數學推算實際並不一定)

「關鍵在於是至少需要多少個氫鍵才能形成穩定度 α結構」

要計算穩定,就要計算其自由能

α螺旋的穩定,和溫度有關(還包括變性劑的影響),不同的氨基酸殘基對能量的貢獻是不同的,丙氨酸是最易形成螺旋的殘基,甘氨酸是最易斷裂螺旋的殘基,兩者對螺旋貢獻係數相差10倍。 最短的肽鏈實驗可能只擁有一個螺旋。

至於你的問題,「多少個氫鍵才能形成穩定度 α結構」不考慮溫度、和具體殘基是很難回答的。 同時穩定是相對的沒有明顯的界限。

α螺旋動力學,最艱難的一步是第一圈的形成,之後的圈是螺旋的延伸,肽鏈太短就難以越過活化能勢壘,總得來說α螺旋的形成速度是極快的。速度是納秒級。

2樓:穎是永遠

根據lehninger 和stryer biochemistry裡的說法,形成一個穩定α helix需要3.6個氨基酸殘基。原因是因為每個殘基相對於另一個鄰接的殘基正好按螺旋軸平移1.

5埃和旋轉100度。

3樓:匿名使用者

13 個

α螺旋α-螺旋(α-helix):蛋白質中常見的二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈c端方向的第4個殘基(第4+n個)的醯胺氮形成氫鍵。

在古典的右手α-螺旋結構中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.

15nm.   【詳解】   α螺旋是一種最常見的二級結構,最先由linus pauling和robert corey於2023年提出,其主要內容是:   ①肽鏈骨架圍繞一個軸以螺旋的方式伸展;   ②螺旋形成是自發的,肽鏈骨架上由n位氨基酸殘基上的-c=o與n+4位殘基上的-nh之間形成的氫鍵起著穩定的作用;被氫鍵封閉的環含有13個原子,因此α螺旋也稱為3.

6/13螺旋;   ③每隔3.6個殘基,螺旋上升一圈;每一個氨基酸殘基環繞螺旋軸100°,螺距為0.54nm,即每個氨基酸殘基沿軸上升0.

15nm;螺旋的半徑是0.23nm;φ角和ψ角分別為-57°和-48°;   ④α螺旋有左手和右手之分,但蛋白質中的α螺旋主要是右手螺旋;   ⑤氨基酸殘基的r基團位於螺旋的外側,並不參與螺旋的形成,但其大小、形狀和帶電狀態卻能影響螺旋的形成和穩定。   【功能】   α-螺旋在dna結合基序(dna binding motifs)中有非常重要的作用,比如在鋅指結構,亮氨酸拉鍊,螺旋-轉角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。

這是因為α-螺旋的直徑為1.2nm,正好和b-dna大溝的直徑相等,所以能夠和b型dna緊密結合。

4樓:海洋之風

多肽鏈形成的a螺旋,每個螺旋由3.6個氨基酸殘基組成,螺距為0.54nm,相鄰的氨基酸之間的距離為0.15nm

求生物化學名詞解釋

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