超聲波能破碎DNA嗎 求助用超聲波打斷基因組DNA

時間 2022-12-23 10:05:11

1樓:魔幻小子

我現在做原核表達一個融合蛋白,其中單鏈抗體基因是合成的(根據大腸桿菌的密碼子偏愛性設計的),表達載體是pet和pgex,做了幾次表達好象蛋白都行成包涵體。

我想請教的問題是:

一 如何判斷是不是形成包涵體,我們實驗室那個破超聲波破碎儀壞了,再沒有超聲波破碎儀的情況下如何破碎菌體,我配了下面二種裂解液。

裂解液的成分:50mmtris-hcl, ,2mm edta,100mm nacl,加溶菌酶至100ug/ml, x-100

裂解液:50mm tris-hcl(, 2mm edta, 100mm nacl, triton x-100, 1mg/ml

再一起用我們那個破破碎儀超但根本打不動,最後我就用反覆凍融法把其中二個在(37和-20反覆凍融)感覺也不行,請問大俠們,你們是如何破碎菌體的,反覆凍融該怎麼搞了?我看別人判斷破碎是不是完全的標準是: 1,外觀判斷:

超聲前菌懸液是渾濁的,超聲完全後變的透明、清澈。

這一項是一個比較常用的方法,以前我的師姐也這麼告訴我的,但我超一個小時還沒有透明?

2,液體的粘滯性:超聲後菌液從槍頭滴下不粘連。

這一項跟沒有看到粘滯性,是不是我破碎時加的液體太多了,大家在超聲時加什麼緩衝液?比例是多少?

3,高速離心:有用高速離心檢測超聲破碎程度的(一般用6,000 g 10 min, 比一般離心收集菌體的轉速高一點)。 沉澱是未破碎或破碎不完全的菌體。

高速離心檢測時6,000 g是不是轉速太低了,我們以前都20000g,離心後再跑膠檢測?

4,染色:破碎後的菌液塗片,革蘭氏結晶紫溶液染色分鐘,鏡檢。

染色後看什麼樣的結果說明破碎完全了?

二 我在做原核表達時,表達載體是pet和pgex,表達條件是:

誘導溫度37度 [iptg]= 時間是3h

表達後檢測是包涵體。

怎麼搞才能使蛋白形成可容性的蛋白?

下面的方法哪個更有效一些:

1 降低表達溫度。(20-30度表達)

2 增加誘導時細菌密度。(od大於。

3 降低表達啟動溫度。(先將菌株冷至20度左右再誘導)

4 降低誘導劑的濃度。(如iptg可小於。

5 增加通氣。(培養瓶中放入1/3左右的培養基,猛烈搖動,增加氧含量,抑制包涵體形成)

6 減少誘導時間。(2-4小時。

2樓:網友

細菌有堅硬的細胞壁,首先要破碎經胞。方。

法有三種:①機械方法:超聲波處理法、研磨法、勻漿法;②化學試劑法:用sds處理細胞; ③酶解法:加入溶菌酶或蝸牛酶,都可使細胞壁破碎。

由於高等動物dna 主要存在於細胞核與線粒體中,所以提取時有兩個困難(高等植物與此類似):

①破碎細胞難;從處死動物٠分離組織器宮到破碎細胞費時長。在此時期間dna 可能會被dn ase降解,而動物組織:特別是肌肉組織很難破碎,即使是較易破碎的肝٠腎等組織也往往使用組織勻漿器,易造成dna 斷裂。

②分子量大,一般比細菌的大2—3個數量級,比病毒的大4—5個數量。對不同生物材料,要根據具體情況選擇適當的分離提取方法。

求助用超聲波打斷基因組dna

3樓:楊風遊

1。從培養的菌液中提取足夠你用的基因組dna,儘量要抽提的純點並儘可能減少機械力對染色體完整性的破壞。

2。超聲的條件主要取決於你的基因組或質粒的g+c含量和你所需片段的大小。一般來說如果你的基因組g+c含量在50%左右,80w*2sec*3次,間歇5秒,可讓你得到5-15k的片段,若要減小片段長度,可增加超聲時間(3sec)或次數(如4次),另外g+c含量越小,則功率也要相應減小,間歇時間延長。

超聲裂解細胞會破壞蛋白和dna作用嗎

4樓:smile我的愛人

超聲裂解細胞的作用原理就是對細胞膜的裂解,一般超聲波的頻率大小會對不同的物質產生不一樣的作用,比如一般裂解細胞的和裂解dna的超聲波頻率不一樣,你這裡說的是會對蛋白和dna產生一定程度的影響的。

超聲波 片段化dna 優缺點?

5樓:鍾瑪

超神魔片的瓦板的優缺點,自己去搜一下。

6樓:ydm開心

超聲多片段化,第二有缺點你可以瞭解就明白他這裡頭都有什麼優點和缺點。

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